<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Medicinal Plants</title>
<title_fa>فصلنامه گياهان دارویی</title_fa>
<short_title>J. Med. Plants</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jmp.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2717-204X</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2717-2058</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi>10.61882/jmp</journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid>14</journal_id_sid>
<journal_id_nlai>8888</journal_id_nlai>
<journal_id_science>13</journal_id_science>
<language>en</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1392</year>
	<month>9</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2013</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>12</volume>
<number>48</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>همسانه‌سازی، آنالیز بیان و بررسی روابط خویشاوندی ژن &lt;i&gt;dbat&lt;/i&gt; از گیاه سرخدار بومی ایران (&lt;i&gt;Taxus baccata&lt;/i&gt; L.)</title_fa>
	<title>Cloning, Gene Expression Analysis, and Phylogenic Relationship of &lt;i&gt;dbat&lt;/i&gt; Gene from Iranian Endemic Yew (&lt;i&gt;Taxus baccata&lt;/i&gt; L.)</title>
	<subject_fa>بيوتكنولوژی</subject_fa>
	<subject>Biotechnology</subject>
	<content_type_fa>پژوهشی</content_type_fa>
	<content_type>Research</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;مقدمه: تاکسول یکی از مهم&#8204;ترین داروهای ضدسرطان می&#8204;باشد که تأمین آن عمدتاً به روش&#8204;های زیستی وابسته می&#8204;باشد. ژن 10- داستیل باکاتین III &amp;ndash; اُ- استیل ترانسفراز (dbat) یکی از ژن&#8204;های کلیدی مسیر بیوسنتزی تاکسول می&#8204;باشد و می&#8204;توان انتظار داشت افزایش بیان آن منجر به افزایش تولید تاکسول در سیستم&#8204;های زیستی شود.&#8204; هدف: بررسی ویژگی&#8204;های ژن dbat از سرخدار بومی ایران، آنالیز بیان ژن و تهیه سازه افزایش بیان ژن مذکور. روش&#8204; بررسی: ابتدا توالی ژن کلون شد. خصوصیات توالی با استفاده از بررسی&#8204;های بیوانفورماتیکی مشخص شد. آنالیز بیان ژن در پاسخ به الیسیتور متیل جاسمونات و در زمان&#8204;های مختلف انجام شد. در نهایت به منظور تهیه سازه افزایش بیان، توالی تحت کنترل پروموتر CaMV35S وکتور pCAMBIA1304 کلون شد. نتایج: مقایسه درجه شباهت توالی مشخص نمود که توالی مذکور بیشترین مشابهت را با توالی Taxus &amp;times; hunnewelliana نشان می&#8204;دهد. یک جایگزینی اسید آمینه&#8204;ای منحصر به فرد در توالی مشاهده شد که بررسی آن نشان داد که تغییر مذکور نمی&#8204;تواند خصوصیات کلی آنزیم را تغییر دهد و بنابراین آنزیم حاصل یک آنزیم فعال می&#8204;باشد. آنالیز بیان ژن نشان داد که در پاسخ به متیل جاسمونات سطوح بیان ژن به میزان حداکثر 24 برابر در 12 ساعت پس از تحریک افزایش می&#8204;یابد. در پایان، درج ژن مذکور در جایگاه مناسب وکتور افزایش بیان توسط آزمون&#8204;های هضمی مورد تأیید قرار گرفت.&#8204; نتیجه&#8204;گیری: تحریک سرشاخه&#8204;های بریده گیاه سرخدار می&#8204;تواند روش جایگزین مناسبی برای کشت&#8204;های سلولی سرخدار به منظور بررسی&#8204;های بیان ژن باشد. سادگی، سهولت و حذف مرحله زمانبر کشت&#8204;های سلولی از مهم&#8204;ترین مزایای آن می&#8204;باشد.&lt;/div&gt;</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Background:&lt;/strong&gt; Taxol is one of the most important anticancer agents that its supply mainly depends on biological processes. 10 - deacetyl baccatin III- O- acetyl transferase (&lt;em&gt;dbat&lt;/em&gt;) gene is one of the key genes in Taxol biosynthetic pathway and it is expected that overexpression of this gene would result in an increased production of taxol in biological systems. &lt;strong&gt;Objective:&lt;/strong&gt; Investigation of &lt;em&gt;dbat&lt;/em&gt; gene characteristics from Iranian endemic yew, Gene expression analysis and Construction of overexpression vector for this gene. &lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt; First, sequence of the gene was cloned and then, sequence characteristics identified with Bioinformatics analysis. Gene expression analysis was performed under methyl jasmonate elicitation in several time-courses. Finally in order to construct overexpression vector, the sequence was cloned under the control of the CaMV35S promoter in to pCAMBIA1304. &lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Comparison of sequence similarities indicated that this sequence is most similar to &lt;em&gt;Taxus &amp;times; hunnewelliana&lt;/em&gt;. There was one unique amino acid substitution and investigating substituted amino acid revealed that, this replacement can not change overall characteristics of the enzyme and thus it would result in a functional enzyme. Analysis of gene expression showed that in response to methyl jasmonate, gene expression levels increased to maximum rate up to 24 times at 12 hours after elicitation. Finally gene insertion in suitable site of overexpression vector, confirmed by digest with restriction enzymes. &lt;strong&gt;Conclusion:&lt;/strong&gt; Elicitation of shoot cuttings of &lt;em&gt;Taxus&lt;/em&gt; would be a suitable alternative for &lt;em&gt;Taxus&lt;/em&gt; cell cultures in gene expression analysis. Simplicity, feasibility, and deletion of time-consuming processes of cell culture are its main advantages.&lt;/div&gt;</abstract>
	<keyword_fa>سرخدار, تاکسول, همسانه‌سازی, الیسیتور, افزایش بیان, بیوانفورماتیک</keyword_fa>
	<keyword>Taxus, Bioinformatics, Cloning, Elicitor, Gene Overexpression, Taxol</keyword>
	<start_page>91</start_page>
	<end_page>103</end_page>
	<web_url>http://jmp.ir/browse.php?a_code=A-10-79-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>M</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Majidi  </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مجیدی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>mmajidi82@yahoo.com</email>
	<code>100319475328460042006</code>
	<orcid>100319475328460042006</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Department of Biotechnology and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>M</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Farsi  </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محمد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>فارسی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460042007</code>
	<orcid>100319475328460042007</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی و به‌نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>AR </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Bahrami </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>احمدرضا</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بهرامی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460042008</code>
	<orcid>100319475328460042008</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Science, Ferdowsi University of Mashhad</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه زیست‌شناسی، دانشگاه فردوسی مشهد، دانشکده کشاورزی</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name> J </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Behravan</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>جواد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>بهروان</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460042009</code>
	<orcid>100319475328460042009</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Pharmacology, Mashhad Medical Science University</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی دارویی، دانشکده داروسازی، دانشگاه علوم پزشکی مشهد</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>SH </first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Marashi </last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید‌حسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>مرعشی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email></email>
	<code>100319475328460042010</code>
	<orcid>100319475328460042010</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Faculty of Agriculture, Ferdowsi University of Mashhad</affiliation>
	<affiliation_fa>گروه بیوتکنولوژی و به‌نژادی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
