fa مقایسه کارایی نشانگر RAPD و Modified RAPD در تعیین تنوع ژنتیکی و فیتوشیمیایی بین جمعیت‌های مختلف گیاه رازیانه (<i>Foeniculum vulgar</i>) بيوتكنولوژی Biotechnology پژوهشی Research <div style="text-align: justify;"><strong>مقدمه:</strong> گیاه دارویی رازیانه (<em>Foeniculum vulgar</em>) متعلق به خانواده چتریان است که دارای کاربردهای فراوانی در صنایع دارویی و غذایی می‌باشد. <strong>هدف:</strong> در این مطالعه، تأثیر هضم آنزیمی محصول RAPD - PCR به منظور افزایش کارایی نشانگر RAPD در ارزیابی تنوعات ژنومی مورد بررسی قرار گرفت. <strong>روش بررسی:</strong> پس از تکثیر DNA ژنومی 15 جمعیت رازیانه با استفاده از 9 آغازگر RAPD، بخشی از محصول PCR توسط دو آنزیم برشی MseI و EcoRI مورد هضم قرار گرفت. سپس محصول PCR هضم شده و بدون هضم، با استفاده از الکتروفورز ژل آگارز تفکیک شد. برای تعیین کارآیی نشانگرها در تفکیک ژنوتیپ‌های مورد مطالعه، از معیار میزان اطلاعات چند شکلی (PIC) و برای گروه‌بندی نمونه‌ها از تجزیه خوشه‌‌ای استفاده شد. همچنین درصد اسانس و اجزای تشکیل‌دهنده آن در جمعیت‌های فوق با استفاده از دستگاه کروماتوگرافی گازی متصل به طیف‌سنج جرمی تعیین شد. <strong>نتایج:</strong> مقایسه الگوی باندی محصول PCR هضم شده و هضم نشده نشان داد که استفاده از یک آنزیم چهاربازبر مانند MseI برای هضم قطعات حاصل از تکثیر RAPD-PCR می‌تواند تا حد قابل توجهی میزان چندشکلی را نسبت به روش RAPD استاندارد افزایش دهد. همچنین تجزیه کلاستر بر اساس داده‌های حاصل از روش RAPD تغییریافته، جمعیت‌ها را به صورت مناسب‌تری گروه‌بندی نمود. <strong>نتیجه‌گیری:</strong> به عنوان یک نتیجه کلی، هضم آنزیمی مناسب محصول PCR می‌تواند کارایی نشانگر مولکولی RAPD را تا حد قابل توجهی در بررسی تنوعات در سطح ژنوم بهبود بخشد. از سوی دیگر نتایج نشان داد که میان عملکرد اسانس و تنوع ژنتیکی موجود همبستگی وجود ندارد.</div> <div style="text-align: justify;"><strong>Background:</strong> Fennel (<em>Foeniculum vulgar</em>) is a medicinal plant species in the Apiaceae family with culinary and medicinal uses. <strong>Objective:</strong> This study was conducted to evaluate the effects of enzymatic digestion of PCR product in improvement of the efficiency of RAPD markers. <strong>Methods:</strong> Nine RAPD primers were used to amplify the genomic DNA of fifteen accessions of Fennel. Following amplification, a part of PCR products was digested with two restriction enzymes (EcoRI and MseI). Both of digested and undigested PCR products were separated on agarose gel electrophoresis. The accessions were grouped by cluster analysis and polymorphic information content index was calculated for each marker. Also percentage and component of essential oil were indicated by GC/MS analysis. <strong>Results:</strong> The comparison of banding patterns of digested and undigested PCR products revealed that digestion of RAPD-PCR product using a four base cutter enzyme such as Mse I shows a higher level of polymorphism as compared to standard RAPD. Cluster analysis based on data obtained by modified RAPD classified accessions more suitable as compared to standard RAPD data. There was no correlation between genetic diversity and metabolic yield. <strong>Conclusion:</strong> Restriction enzymes have enormous potential to improve the efficiency of RAPD markers in evaluation of genetic diversity across genome.</div> Foeniculum vulgar, اسانس, تنوع ژنتیکی, هضم آنزیمی, RAPD Foeniculum vulgar, Enzymatic digestion, Essential oil, Genetic diversity, RAPD 40 53 http://jmp.ir/browse.php?a_code=A-10-75-1&slc_lang=fa&sid=1 A Etminan علیرضا اطمینان 100319475328460041970 100319475328460041970 No Department of Plant Breeding, Kermanshah Branch, Islamic Azad University, Kermanshah دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، گروه اصلاح نباتات L Shooshtari لیا شوشتری 100319475328460041971 100319475328460041971 No Department of Plant Breeding, Kermanshah Branch, Islamic Azad University, Kermanshah دانشگاه آزاد اسلامی، واحد کرمانشاه، گروه اصلاح نباتات M Ghorbanpour منصور قربانپور 100319475328460041972 100319475328460041972 No Faculty of Agriculture and Natural Resources, Arak University گروه گیاهان دارویی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک A Mehrafarin علی مهرآفرین 100319475328460041973 100319475328460041973 No Cultivation and Development Department of Medicinal Plants Research Center, Institute of Medicinal Plants, ACECR گروه کشت و توسعه گیاهان دارویی مرکز تحقیقات گیاهان دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاددانشگاهی A Qaderi اردشیر قادری Ardeshir582003@yahoo.com 100319475328460041974 100319475328460041974 Yes Biotechnology Department of Medicinal Plants Research Center, Institute of Medicinal Plants, ACECR, Karaj گروه بیوتکنولوژی گیاهان دارویی مرکز تحقیقات گیاهان دارویی، پژوهشکده گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی